期刊简介

《国际病毒学杂志》是专业刊载病毒学基础、临床、药物、疫苗、防控等的综合性专业学术医学期刊。主要设有述评、笔谈、论著、综述、讲座、临床病理(病例)讨论、国际交流、疫情报告、会议纪要及国内外学术动态等栏目。读者为本专业科研人员,从事医学病毒学研究的科研人员;高、中等医药院校的有关教学人员;病毒性传染病的临床医师;生物制品工作者;各级卫生防疫工作者;临床检验工作者,以及与人畜共患病毒性疾病防治有关的科技工作者。

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  • 杂志名称:国际病毒学杂志
  • 主管单位:国外医学(病毒学分册)
  • 主办单位:国家卫生健康委员会
  • 国际刊号:18-223
  • 国内刊号:1673-4092
  • 出版周期:
期刊荣誉:中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录:
国际病毒学杂志2017年第6期

上海市柯萨奇病毒A6型流行株基因进化与选择压力分析

张晓玲;俞慧菊;宋志刚;王蔚

关键词:柯萨奇病毒A6型, 基因进化, 选择压力
摘要:目的 对上海市柯萨奇病毒A6型(CVA6)流行株的基因进化和选择压力进行分析,为今后手足口病的防治提供理论依据.方法 选取美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中的CVA6参考序列,与2011-2015年上海地区CVA6流行株的VP1基因序列进行比对,采用MEGA软件构建进化树;扩增2014-2015年上海地区CVA6流行株的全长基因序列,采用Bioedit软件计算氨基酸置换熵值,用Datamonkey在线软件预测正向选择位点.结果 基于VP1基因序列的进化树显示2011-2015年上海地区的CVA6流行株为D3、D6和D7亚型,2014年后为D7亚型.氨基酸置换熵值计算共获得39个熵值>0.6的位点.选取FEL和IFEL模型分析分别发现3个和4个正向选择位点,VP1的595位和3D区的1 999位为分析获得的共同氨基酸变异位点.结论 2014-2015年,上海地区流行的CVA6属于D7亚型,VP1区未出现显著的基因变异,应继续保持对上海地区CVA6的基因进化趋势研究并密切关注基因变异情况.